بررسی تنوع ژنتیکی marinobacter sp. موجود در دریاچه گوری گول آذربایجان شرقی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده علوم کشاورزی
- نویسنده وحیده طرح ریز
- استاد راهنما محمد سعید حجازی محمد امین حجازی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1388
چکیده
چکیده باکتری¬های شورپسند مناطق معتدل، گروهی از باکتری¬ها هستند که به زندگی در محیط¬های با 20-0 در صد نمک سازش یافته اند . اعضاء خانواده¬ alteromonaceae، از باکتری های شورپسند ملایم ، باکتری های گرم منفی، متحرک و هوازی بوده که دارای قابلیت رشد در محیط¬های بی¬هوازی هستند و در صورت رشد در محیط¬های بی هوازی با تخمیر به روشهای متفاوتی نظیر دنیتریفیکاسیون رشد می¬کنند. بیشتر آنها ترکیباتی تولید می کنند که از نظر صنعتی مورد توجه¬اند مانند آنزیم¬ها، پلی¬مرها و محافظ¬های اسمزی، این باکتری ها همچنین دارای خصوصیات فیزیولوژیکی مفیدی هستند که بهره برداری از آنها را در زمینه¬های تجاری تسهیل می¬کند¬. با توجه به اهمیت اقتصادی تیرهalteromonaceae در صدد بررسی حضور این باکتری در دریاچه گوری گول بر آمدیم. جهت نیل به این منظور، 4 نمونه در 3 تکرار از عمق¬های مختلف شامل: نواحی ساحلی، نواحی کم عمق یک متری، نواحی عمیق 2-4 متری و نواحی خیلی عمیق 6 متر به پائین تر برداشته و در ظروف استریل به آزمایشگاه بیوتکنولوژی داروئی تبریز منتقل گردیدند. نمونه¬های آبی روی 3 محیط مختلف، در دمای 30-20 درجه سانتی گراد بمدت 3 تا20 روز کشت شدند. سپس باکتری های رشد یافته به صورت تک کلونی جداسازی شدند و به پژوهشکده برنج و مرکبات ساری منتقل شده و پس از استخراجdna ژنومی با استفاده از آغازگر های عمومی، ژن 16s rrna ناحیه 1500 جفت باز تکثیر و به منظور تعیین ترادف به شرکت macrogene ارسال شد. نتایج حاصل از 20 آزمایش بیوشیمیائی و فیزیولوژیکی روی جدایه ها نشان داد که باکتری های گرم منفی جدا شده هوازی بوده و دارای رشد بهینه در دمای 25- 15 در جه سانتی گراد، 7-6 = ph و 75/9 گرم بر لیتر nacl می باشند. مقایسه داده های حاصل از تعیین ترادف با ترادف های بانک اطلاعات ncbi نشان داد که جدایه st7 با باکتری shewanella xiamenensis s4(t)¬¬، %98 تشابه داشت. علاوه برتفاوت ژن 16s rrna، تفاوت بیوشیمیائی از جمله اختلاف در تست اکسیداز را می توان نام برد. از اینرو نمونه یاد شده به عنوان یک جدایه جدید گزارش و ترادف آن به طول 1489 جفت باز در¬¬ ¬بانک ژن ncbi با شماره gq988720 ثبت گردید. در این مطالعه همچنین جدایه st4 با باکتری alishewanella agri bl06(t) ، %97 تشابه داشت. به همین جهت این نمونه نیز به عنوان یک جدایه جدید گزارش و ترادف آن با 1388 جفت باز در ncbi با شماره gq505294 ثبت گردید. در این مطالعه همچنین 12 باکتری نظیر agrobacterium sanguineum و paracoccus marcusii جداسازی و شناسائی شدند علاوه بر آن جدایه st30 از نظر مورفولوژی و ژنوتیپی جزء باکتری های جنس marinobacter sp. بود. که نیاز به بررسی بیشتر دارد. مطالعه این باکتری ها از نظر تولید آنزیم های هیدرولیتیکی و تولید کاروتنوئید ها از پتانسیل های جالب و قابل بهره برداری برخوردار می باشند. کلمات کلیدی: باکتری¬های شورپسند، alteromonaceae ، ژن 16s rrna، فنوتیپ.
منابع مشابه
Marinobacter salarius sp. nov. and Marinobacter similis sp. nov., Isolated from Sea Water
Two non-pigmented, motile, Gram-negative marine bacteria designated R9SW1T and A3d10T were isolated from sea water samples collected from Chazhma Bay, Gulf of Peter the Great, Sea of Japan, Pacific Ocean, Russia and St. Kilda Beach, Port Phillip Bay, the Tasman Sea, Pacific Ocean, respectively. Both organisms were found to grow between 4 °C and 40 °C, between pH 6 to 9, and are moderately halop...
متن کاملتنوع ردهبندی و ژنتیکی خاک در واحدهای مختلف ژئومرفیک در منطقه مرند، آذربایجان شرقی
در این پژوهش از غنا و تنوع ردهبندی خاک برای بررسی تکامل خاک در چهار واحد ژئومرفیک پدیمنت سنگی و پدیمنت پوشیده، دشت دامنهای و دشت آبرفتی و از غنای ژنتیکی برای ارزیابی تأثیر سیستم طبقهبندی بر غنای خاک در منطقه مرند استفاده گردید. تعداد 26 پروفیل در درون واحدهای مختلف حفر و نمونه برداری شد. محاسبه شاخصهای تنوع خاک با در نظر گرفتن خاکفردها و مساحت هر نوع خاک در سطوح مختلف سیستم جامع طبقهبندی ...
متن کاملMarinobacter goseongensis sp. nov., from seawater.
A Gram-negative marine bacterium, designated strain En6(T), was isolated from seawater of the East Sea of Korea. The organism grew in 1-25 % (w/v) NaCl and at 10-37 degrees C and pH 5.3-9.3, with optimal growth occurring in 4-5 % NaCl and at 25-30 degrees C and pH 7.5. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequence of strain En6(T) placed this bacterium in the clade Marinobacter within the...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگرهای مورفولوژیکی و فیتوشیمیایی درگونه های مختلف خرگوشک (Verbascum sp.) در استان آذربایجان غربی
سابقه و هدف: گل ماهور یا خرگوشک (Verbascum sp.) گیاهی علفی، دوساله، دارویی و متعلق به تیره گل میمون (Scrophulariaceae) میباشد. از گلهای این گیاه به عنوان یک داروی گیاهی باارزش برای درمان التهاب، آسم، سرفه و همچنین درمان ناراحتیهای دستگاه تنفسی استفاده میشود. در این تحقیق تنوع ژنتیکی گونههای مختلف خرگوشک جمعآوری شده از مناطق مختلف استان آذربایجان غربی بر اساس برخی نشانگرهای مورفولوژیکی و ف...
متن کاملComplete Genome Sequence of Marinobacter sp. BSs20148
Marinobacter sp. BSs20148 was isolated from marine sediment collected from the Arctic Ocean at a water depth of 3,800 m. Here we report the complete genome sequence of Marinobacter sp. BSs20148. This genomic information will facilitate the study of the physiological metabolism, ecological roles, and evolution of the Marinobacter species.
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده علوم کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023